1. 神经科学
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细胞外波形的非线性降维揭示了运动前皮层细胞类型的多样性

  1. Eric吴克群李
  2. 海马瓦蒂·巴拉苏布拉曼尼安
  3. 亚历山德拉Tsolias
  4. Stephanie Udochukwu Anakwe
  5. 玛丽亚Medalla
  6. 克里希纳V谢诺
  7. 钱德拉穆利·钱德拉塞卡兰 是通讯作者
  1. 美国波士顿大学
  2. 德国伯恩斯坦计算神经科学中心
  3. 美国波士顿大学
  4. 斯坦福大学,美国
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引用本文金沙官网注册网址为:eLife 2021;10:e67490 doi:10.7554 / eLife.67490

摘要

皮质回路被认为包含大量协调产生行为的细胞类型。目前的体内方法依赖于细胞外波形特定特征的聚类来识别假定的细胞类型,但这些方法仅捕获少量的变异。在这里,我们开发了一种新的方法(WaveMAP),它将非线性降维与图聚类相结合来识别假定的细胞类型。我们将波形图应用于从执行决策任务的猕猴背侧运动前皮质记录的细胞外波形。使用WaveMAP,我们稳健地建立了八个波形簇,并表明这些簇再现了先前确定的窄峰和宽峰类型,同时揭示了这些亚型中先前未知的多样性。这八个团簇表现出明显的层流分布、特征放电率模式和决策相关动力学。当使用基于特征的方法时,这种洞察力较弱。因此,波形图提供了对皮质回路中细胞类型动力学的更细致的理解。

数据可用性

本研究期间生成或分析的数据包含在链接的Dryad存储库中(doi:10.5061/Dryad.z612jm6cf)。所有图形的源数据也在此zip文件中。

生成了以下数据集

金沙官网注册网址文章和作者信息

作者详细信息

  1. Eric吴克群李

    心理和脑科学,波士顿大学,波士顿,美国
    相互竞争的利益
    作者宣称不存在相互竞争的利益。
    兽人图标 “此ORCID iD标识本文的作者:”金沙官网注册网址0000-0002-7166-0909
  2. 海马瓦蒂·巴拉苏布拉曼尼安

    伯恩斯坦计算神经科学中心,伯恩斯坦计算神经科学中心,柏林,德国
    相互竞争的利益
    作者宣称不存在相互竞争的利益。
  3. 亚历山德拉Tsolias

    解剖学和神经生物学,波士顿大学,美国波士顿
    相互竞争的利益
    作者宣称不存在相互竞争的利益。
  4. Stephanie Udochukwu Anakwe

    神经科学本科课程,波士顿大学,波士顿,美国
    相互竞争的利益
    作者宣称不存在相互竞争的利益。
  5. 玛丽亚Medalla

    解剖学与神经生物学,波士顿大学,美国波士顿
    相互竞争的利益
    作者宣称不存在相互竞争的利益。
  6. 克里希纳V谢诺

    斯坦福大学电机工程系,斯坦福,美国
    相互竞争的利益
    作者宣称不存在相互竞争的利益。
  7. 钱德拉穆利·钱德拉塞卡兰

    解剖学和神经生物学,波士顿大学,美国波士顿
    为对应
    cchandr1@bu.edu
    相互竞争的利益
    作者宣称不存在相互竞争的利益。
    兽人图标 “此ORCID iD标识本文的作者:”金沙官网注册网址0000 - 0002 - 1711 - 590 - x

资金

国家神经疾病和中风研究所(R00NS092972)

  • 钱德拉穆利·钱德拉塞卡兰

国家耳聋和其他沟通障碍研究所(DC017844)

  • 克里希纳V谢诺

国家神经疾病和中风研究所(NS095548)

  • 克里希纳V谢诺

国家神经疾病和中风研究所(NS098968)

  • 克里希纳V谢诺

国防高级研究计划局(N66001-10-C-2010)

  • 克里希纳V谢诺

国防高级研究计划局(W911NF-14-2-0013)

  • 克里希纳V谢诺

西蒙斯基金会(325380)

  • 克里希纳V谢诺

西蒙斯基金会(543045)

  • 克里希纳V谢诺

国家神经疾病和中风研究所(122969)

  • 钱德拉穆利·钱德拉塞卡兰

海军研究办公室(N000141812158)

  • 克里希纳V谢诺

拉里和帕梅拉·加利克

  • 克里希纳V谢诺

国家神经疾病和中风研究所(K99NS092972)

  • 钱德拉穆利·钱德拉塞卡兰

斯坦福大学吴财神经科学研究所

  • 克里希纳V谢诺

洪世和林惠芳获授教授职位

  • 克里希纳V谢诺

霍华德休斯医学院

  • 克里希纳V谢诺

国家精神卫生研究所(R00MH101234)

  • 玛丽亚Medalla

国家心理健康研究所(R01MH116008)

  • 玛丽亚Medalla

白厅基金会(2019-1277)

  • 钱德拉穆利·钱德拉塞卡兰

脑与行为研究基金会(27923)

  • 钱德拉穆利·钱德拉塞卡兰

国家卫生研究院院长办公室(DP1HD075623)

  • 克里希纳V谢诺

国家耳聋和其他沟通障碍研究所(DC014034)

  • 克里希纳V谢诺

资助方没有参与研究设计、数据收集和解释,也没有决定是否将研究提交出版。

伦理道德

动物实验:本研究严格按照美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)《实验动物护理和使用指南》(Guide for the Care and Use of Laboratory Animals)中的建议进行。所有的程序都是由斯坦福实验室动物护理管理委员会批准的(aplac8856号协议,标题为“手臂运动的皮层加工”)。手术是在麻醉下进行的,并尽一切努力减少痛苦。手术批准后,在需要时给予适当的镇痛、止痛药和抗生素。

检查编辑器

  1. Emilio Salinas,维克森林医学院,美国

出版的历史

  1. 已张贴预印本:2021年2月8日(查看预印本)
  2. 收到日期:2021年2月12日
  3. 接受日期:2021年8月4日
  4. 接受的手稿发表:2021年8月6日(第1版)
  5. 接受手稿更新:2021年8月10日(第2版)
  6. 接受手稿更新:2021年8月12日(第3版)

版权

©2021年,Lee等人。

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指标

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