1. 遗传学和基因组学
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转录因子Xrp1在perk介导的抗氧化基因诱导中是必需的果蝇

  1. 布莱恩•布朗
  2. Sahana Mitra
  3. 芬尼根D罗奇
  4. 迪Vasudevan
  5. Hyung Ryoo不 是通讯作者
  1. 美国纽约大学格罗斯曼医学院
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  • 注释
引用这篇文章金沙官网注册网址为:eLife 2021; 10: e74047 doi:10.7554 / eLife.74047

摘要

PERK是一种内质网(ER)跨膜传感器,磷酸化eIF2a以启动未折叠蛋白反应(UPR)。eIF2a磷酸化促进应激反应基因的表达,最显著的是通过转录因子ATF4,该转录因子包含一个调节5' leader。除了ATF4,可能的PERK效应仍然知之甚少。在这里,我们报道了bZIP转录因子Xrp1在atf4独立的PERK信号通路中是必需的。细胞类型特异性基因表达谱果蝇谷胱甘肽- s转移酶(gstD)明显是由激活uprr的转基因诱导的Rh1G69D活跃这是必要的,也是充分的吗gstD感应,但ATF4不是必需的。相反,活跃等eIF2a磷酸化调控因子调控Xrp1蛋白水平诱导gstDs.的Xrp15' leader有一个保守的上游开放阅读框(uORF),类似于那些调节ATF4翻译。的gstD-GFP报告基因诱导需要假定的Xrp1结合位点。这些结果表明抗氧化基因是由之前未被识别的UPR信号轴PERK和Xrp1高度诱导的。

数据可用性

测序数据已保存在GEO中,加入代码为GSE150058。图2-6和图8提供了源数据文件。

生成了以下数据集

金沙官网注册网址文章和作者信息

作者详细信息

  1. 布莱恩•布朗

    美国纽约大学格罗斯曼医学院
    相互竞争的利益
    作者宣称不存在相互竞争的利益。
    ORCID图标 "此ORCID iD标识本文作者:"金沙官网注册网址0000-0001-9826-4052
  2. Sahana Mitra

    美国纽约大学格罗斯曼医学院
    相互竞争的利益
    作者宣称不存在相互竞争的利益。
  3. 芬尼根D罗奇

    美国纽约大学格罗斯曼医学院
    相互竞争的利益
    作者宣称不存在相互竞争的利益。
  4. 迪Vasudevan

    美国纽约大学格罗斯曼医学院
    相互竞争的利益
    作者宣称不存在相互竞争的利益。
  5. Hyung Ryoo不

    美国纽约大学格罗斯曼医学院
    为对应
    hyungdon.ryoo@nyumc.org
    相互竞争的利益
    作者宣称不存在相互竞争的利益。
    ORCID图标 "此ORCID iD标识本文作者:"金沙官网注册网址0000 - 0002 - 1046 - 535 - x

资金

国家眼科研究所(R01 EY020866)

  • Hyung Ryoo不

国家普通医学科学研究所(R01 GM125954)

  • Hyung Ryoo不

国家普通医学科学研究所(T32 GM136573)

  • 布莱恩•布朗

尤尼斯·肯尼迪·施莱弗国家儿童健康和人类发展研究所(T32 HD007520)

  • 布莱恩•布朗

国家眼科研究所(K99 EY029013)

  • 迪Vasudevan

资助方没有参与研究设计、数据收集和解释,也没有决定是否将研究提交出版。

检查编辑器

  1. Julie Hollien,犹他大学,美国

出版的历史

  1. 收稿日期:2021年9月20日
  2. 录用日期:2021年9月27日
  3. 接受的手稿发表:2021年10月4日(版本1)

版权

©2021,Brown等。

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    脊髓性肌肉萎缩(SMA)是一种以第二运动神经元变性为特征的神经肌肉疾病。表型从非常严重到非常轻微。所有患者均为纯合子性缺失SMN1基因和数量可变的SMN2(一般2-4份),与严重程度成反比。现有治疗方法的惊人结果使人们迫切需要预后生物标志物来预测患者的病情发展轨迹。除了SMN2到目前为止,很少有其他生物标志物被评估,包括一些miRs。

    方法:

    我们对患者和对照组的肌肉样本(14例活检和9例培养)进行了完整的miRNome分析。在51例患者和37例对照组的血清样本中评估肌肉差异表达miRs的水平,并进行整合SMN2册,SMN2血液和年龄的全长转录水平(sma评分)。

    结果:

    SMA肌肉中有100多个miRs差异表达;其中3个(hsa-miR-181a-5p, -324-5p, -451a;SMA-miRs)在患者血清中显著上调。sma评分预测的严重程度与临床分级的相关系数为0.87 (p<10)-5).

    结论:

    miRNome分析表明骨骼肌是SMA发病的主要因素。SMA-miRs可能在血流中积极释放;它们的功能和靶细胞需要阐明。sma评分的准确性需要在重复研究中得到验证:如果得到证实,它的应用可能对常规预后评估至关重要,对症状前患者也是如此。

    资助:

    意大利Telethon (grant #GGP12116)。

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